01 · Sourcing & Transformation01 · Sourcing & Transformation

Hub Mondial de Réactifs - sourcer l'excellence

Global Reagent Hub - sourcing excellence

GlycUp est un partenaire privilégié des leaders mondiaux fournisseurs de cellules, anticorps et réactifs.
Nous sécurisons l'accès aux composants essentiels pour la recherche européenne traditionnellement ouverte sur le monde et particulièrement auprès des grands pôles que constituent les Amériques, l'Asie et l'Océanie.

GlycUp is a privileged partner of the world's leading suppliers of cells, antibodies and reagents. We secure access to the essential components for European research, traditionally open to the world and particularly to the major hubs of the Americas, Asia and Oceania.

Transformation à haute valeur ajoutée et enrichissement de substances

High value-added transformation and enrichment of substances

Adaptation et transformation des produits importés pour répondre aux besoins spécifiques de la recherche : marquage, purification, conditionnement. Nos substances de prédilection sont les anticorps, cellules, héparanes sulfates, biotines et glycanes complexes. Nous sommes complètement équipés pour leur traitement et leur conservation. Nous procédons à des contrôles qualité rigoureux à chaque étape critique de la vie du produit (ELISA, Western BLOT).

Adaptation and transformation of imported products to meet the specific needs of research: labeling, purification, packaging. Our preferred substances are antibodies, cells, heparan sulfates, biotins, and complex glycans.. We are fully equipped for their processing and storage. We perform rigorous quality controls at every critical stage of the product lifecycle (ELISA, Western BLOT).

Fluidification à l'importation, dédouanement & Logistique

Import, Customs Clearance & Logistics

Chaque laboratoire a été confronté à la perte d'un produit, à une mauvaise conservation à température, à une rétention en douane interminable mettant en danger les propriétés de substances onéreuses et difficiles à obtenir. GlycUp agit comme une agence pour faciliter les échanges entre laboratoires et particulièrement sur les phases critiques que constituent le transport et le passage en douane.

Every laboratory has faced the loss of a product, improper temperature storage, or lengthy customs delays that jeopardize the properties of expensive and hard-to-obtain substances. GlycUp acts as an agency to facilitate exchanges between laboratories, particularly during the critical phases of transport and customs clearance.

02 · Formation, Conseil & Accompagnement02 · Training, Consulting & Support

Expertise & Accélération Scientifique

Expertise & Scientific Acceleration

Au-delà du conseil, nous nous constituons comme partenaires dans la réussite de vos projets de recherche.
GlycUp vous accompagne de la conception jusqu'aux résultats en passant par les apports en méthode et correctifs nécessaires à la réussite de vos expériences. GlycUp peut vous aider à garantir que vos personnels de laboratoire, ingénieurs et techniciens, bénéficient de l'assurance qualité et de tous les apports technologiques à jour.
Nous assistons régulièrement des équipes qui ne sont pas forcément expertes dans la manipulation en glycobiologie, mais pour lesquelles nous aidons à combler les compétences requises ponctuellement dans leurs observations.

Beyond consulting, we act as partners in the success of your research projects. GlycUp supports you from design through to results, providing methodological input and corrective actions necessary for the success of your experiments. GlycUp can help ensure that your laboratory staff, engineers and technicians alike, benefit from quality assurance and the latest technological advancements. We regularly assist teams that are not necessarily experts in glycobiology techniques, helping to fill specific skill gaps required for their observations.

Conseil stratégique

Strategic Consulting

Aide au design expérimental et à l'optimisation des protocoles en vue d'une meilleure efficience de la recherche et d'une meilleure efficacité des manipulations.

Support for experimental design and protocol optimization to enhance research efficiency and the effectiveness of experimental procedures..

Accélération Scientifique

Scientific Acceleration

Notre rythme de publication nous permet de capitaliser sur une veille scientifique toujours à jour et d'offrir un support efficace à la rédaction d'articles à destination des laboratoires et unités de recherche publiques et privées.

Our publication pace enables us to capitalize on continuously updated scientific monitoring and to provide effective support for writing articles intended for public and private laboratories and research units.

03 · Calcul & IA03 · Computing & AI

In Silico : la Glycobiologie à l'ère de l'IA

In Silico: Glycobiology in the Age of AI

Avec le soutien de notre partenaire fondateur de Glycanix, expert en bio-informatique, nous proposons des services consolidant les piliers de la conception de médicaments assistée par ordinateur (CADD - Computer-Aided Drug Design). Nous respectons les différentes étapes au moyen de nos outils informatiques pour modéliser l’action moléculaires dans le cadre des traitements de demain avant même de synthétiser la moindre molécule ou de lancer le moindre test en laboratoire.
GlycUp et Glycanix mobilisent des ressources informatiques en stockage et en calcul et peuvent faire usage de technologies digitales ad-hoc de haute performance pour simuler les interactions moléculaires. Nos algorithmes figurant déjà au cœur de nos brevets sont placés au service d'une recherche accélérée par un meilleur ciblage des problématiques thérapeutiques. Nous offrons cette capacité à nos clients en co-construisant des projets complets depuis l’approche des mécanismes jusqu’à la modélisation des traitements sans compter les contributions à l’application concrète des traitements aux patients qui reste notre ligne de mire.

With the support of our founding partner Glycanix—an expert in bioinformatics—we offer services that reinforce the pillars of Computer-Aided Drug Design (CADD). We utilize computational tools to model molecular action for future therapies at every stage of the process, long before a single molecule is synthesized or a laboratory test is initiated.
GlycUp and Glycanix leverage high-performance computing and storage resources, employing specialized digital technologies to simulate molecular interactions. Our proprietary algorithms—central to our patents—drive accelerated research by enabling more precise targeting of therapeutic challenges. We deliver this capability to our clients through the co-development of comprehensive projects, spanning everything from mechanistic analysis and treatment modeling to the practical application of therapies for patients, which remains our ultimate goal.

Modélisation moléculaire

Molecular Modeling

Notre vision de la modélisation consiste en la construction de modèles prédictifs permettant de formaliser le comportement des molécules avant le passage à la paillasse.
Pour ce travail in silico (sur ordinateur) nous regroupons toutes les techniques informatiques permettant de représenter, de manipuler et de simuler le comportement en 3D des molécules (aussi bien la grande protéine cible que les petites molécules candidates).

 · L'objectif : Calculer la géométrie, l'énergie, et la répartition des charges électriques d'une molécule.

 · L'utilité : Restituer le fonctionnement du mécanisme dans les données et dans ses représentations graphiques.

Our approach to modeling involves constructing predictive models to formalize molecular behavior prior to bench-top experimentation.
For this *in silico* (computer-based) work, we combine computational techniques that enable the representation, manipulation, and simulation of molecular behavior in 3D—covering both large target proteins and small-molecule candidates.

 · The goal: To calculate a molecule's geometry, energy, and electrical charge distribution.

 · The utility: To capture the mechanism's operation within the data and graphical representations.

Drug discovery (la découverte de médicaments)

Drug Discovery

Au lieu de découvrir les médicaments par hasard comme cela a été le cas de trop nombreuses fois dans l’histoire de la médecine, ou en testant aveuglément des milliers de composés (criblage à haut débit in vitro), nous procédons à une drug discovery aux standards contemporains hautement ciblée. Elle commence par l'identification d'une cible biologique responsable d'une pathologie (protéine, enzyme, etc.). Le but est ensuite de trouver un principe actif sous forme de molécule capable de s'y lier pour bloquer ou activer son action. C'est ici que l'informatique entre en jeu pour gagner un temps précieux.

Instead of discovering drugs by chance—as has happened all too often in the history of medicine—or by blindly testing thousands of compounds (high-throughput *in vitro* screening), we employ a highly targeted, modern approach to drug discovery. It begins with identifying a biological target responsible for a disease (such as a protein or enzyme). The goal is then to find an active molecule capable of binding to that target to block or activate its function. This is where computer technology comes into play, saving valuable time.

Le Pharmacophore

The Pharmacophore

C'est le plan architectural minimal dont une molécule a besoin pour être active : il permet de filtrer en qualifiant les caractéristiques physico-chimiques indispensables et leur disposition dans l'espace.
Un modèle pharmacophorique ne s’attache pas tant aux atomes qu’à leurs propriétés (donneurs de liaison hydrogène, disposition spatiale des interactions hydrophobes des cycles aromatiques, charges positives ou négatives).

 · L'utilité : C'est un excellent moyen de trouver de nouvelles classes de médicaments ou d'éviter des brevets existants : si l’on connaît le pharmacophore d'une cible, on peut interroger une base de données pour chercher toutes les molécules qui possèdent ces caractéristiques spatiales.

The pharmacophore is the minimal architectural plan that a molecule needs to be active: it allows filtering by qualifying the indispensable physico-chemical characteristics and their arrangement in space.
A pharmacophoric model does not focus on atoms but on their properties (hydrogen bond donors, spatial arrangement of hydrophobic interactions of aromatic cycles, positive or negative charges).

 · The utility: It is an excellent way to find new classes of drugs or avoid existing patents: if we know the pharmacophore of a target, we can query a database to search for all molecules that possess these spatial characteristics.

Le Docking (l'amarrage moléculaire)

Molecular Docking

Le docking est l'équivalent informatique du test de validation entre cible et principe actif : il permet d’affiner la recherche. Il permet de voir précisément comment les meilleurs candidats s'insèrent dans la cible biologique.
Une fois que nous avons obtenu le modèle 3D d’une cible et d'une molécule candidate (le ligand), l'algorithme de docking va calculer toutes les orientations et conformations possibles de la petite molécule à l'intérieur de la poche de la cible.

 · Le score d'affinité : Notre traitement de données massives attribue un score basé sur les interactions physiques et chimiques (liaisons hydrogène, forces de van der Waals, interactions hydrophobes).

 · Criblage virtuel : Le docking permet de tester virtuellement des millions de molécules en quelques jours pour ne garder que les meilleures qui seront ensuite réellement testées en laboratoire.

Molecular docking is the computational equivalent of experimental validation between target and active compound: it allows for refining the search. It enables us to precisely visualize how the best candidates fit into the biological target.
Once we have obtained the 3D model of a target and a candidate molecule (the ligand), the docking algorithm calculates all possible orientations and conformations of the small molecule within the target's binding pocket.

 · The binding affinity score: Our large-scale data processing assigns a score based on physical and chemical interactions (hydrogen bonds, van der Waals forces, hydrophobic interactions).

 · Virtual screening: Molecular docking allows for virtually testing millions of molecules in a short time to retain only the best ones, which are then experimentally validated in the laboratory.

Focus d'ExcellenceExcellence Focus

Cerveau & Neurosciences.

Brain & Neuroscience.

1. Introduction et Périmètre de Recherche

1. Introduction and Research Scope

GlycUP est une entité de facilitation de la recherche au niveau national et international pour son expertise fondamentale en glycobiologie. Historiquement associé à la réparation et à la régénération tissulaires, le laboratoire développe depuis sa création un axe de recherche prioritaire extrêmement fort dédié à la neurobiologie et aux maladies neurodégénératives.

GlycUP is a research facilitation entity operating at both national and international levels, recognized for its fundamental expertise in glycobiology. Historically associated with tissue repair and regeneration, the laboratory has developed since its creation a highly prioritized research axis dedicated to neurobiology and neurodegenerative diseases.

La Pr. Dulce Papy-Garcia part d'un postulat novateur : l'environnement qui entoure nos neurones, appelé la Matrice Extracellulaire (MEC), n'est pas un simple "ciment" passif. Il s'agit d'un réseau de signalisation dynamique particulièrement riche en sucres complexes appelés Glycosaminoglycanes (GAGs), dont font partie les héparanes sulfates (HS). L'altération de ces sucres avec l'âge joue un rôle clé dans le déclenchement et la progression des pathologies du cerveau.

Prof. Dulce Papy-Garcia starts from an innovative postulate: the environment surrounding our neurons, called the Extracellular Matrix (ECM), is not a simple passive "cement". It is a dynamic signaling network particularly rich in complex sugars called Glycosaminoglycans (GAGs), which include heparan sulfates (HS). The age-related alteration of these sugars plays a key role in the onset and progression of brain pathologies.

2. Le Rôle Clé de la Glycobiologie dans le Cerveau

2. The Key Role of Glycobiology in the Brain

Les recherches en neurosciences de GlycUP se focalisent sur le décryptage du "code" glycanique. Dans un cerveau sain, les héparanes sulfates régulent la croissance neuronale, la plasticité synaptique et la communication cellulaire en liant des facteurs de croissance.

GlycUP's neuroscience research focuses on deciphering the glycanic "code". In a healthy brain, heparan sulfates regulate neuronal growth, synaptic plasticity, and cellular communication by binding growth factors.

Cependant, l'équipe a mis en évidence que dans le cadre du vieillissement et des processus neurodégénératifs, des enzymes spécifiques (les sulfotransférases) modifient de manière pathologique la structure de ces sucres. Ces héparanes sulfates "anormaux" perdent alors leur fonction neuroprotectrice. Pire, ils se transforment en acteurs toxiques capables de fixer, d'agréger et de faciliter la propagation de protéines pathologiques (comme la protéine Tau) de neurone en neurone.

However, the team has shown that during aging and neurodegenerative processes, specific enzymes (sulfotransferases) pathologically modify the structure of these sugars. These "abnormal" heparan sulfates then lose their neuroprotective function. Worse, they become toxic actors capable of binding, aggregating, and facilitating the propagation of pathological proteins (like the Tau protein) from neuron to neuron.

3. Principaux Axes de Recherche en Neurosciences

3. Main Neuroscience Research Axes

Maladie d'Alzheimer et Démences Apparentées : C'est le fer de lance de l'axe neurologique de GlycUP. Les travaux sur la maladie d'Alzheimer, récompensés notamment par le prestigieux prix France Alzheimer, cherchent à comprendre comment les altérations des héparanes sulfates précipitent le déclin cognitif. L'équipe explore les mécanismes intimes par lesquels les sucres altérés de la matrice extracellulaire agissent comme des « récepteurs » qui capturent les formes toxiques de la protéine Tau, facilitant sa propagation dans le cerveau. Les travaux intègrent des chercheurs de pointe spécialisés dans la modélisation des pathologies neurodégénératives (Alzheimer comme Parkinson). Son association avec des centres de recherche reconnus permet l'accès à des modèles cellulaires et d'organoïdes cérébraux pour étudier la plasticité synaptique, l'inflammation et l'agrégation protéique.

Alzheimer's Disease and Related Dementias: This is the spearhead of GlycUP's neurological axis. The work on Alzheimer's disease, rewarded notably by the prestigious France Alzheimer prize, seeks to understand how alterations in heparan sulfates precipitate cognitive decline. The team explores the intimate mechanisms by which altered extracellular matrix sugars act as "receptors" that capture toxic forms of the Tau protein, facilitating its spread in the brain. The work integrates top researchers specialized in modeling neurodegenerative pathologies (Alzheimer's and Parkinson's). Its association with recognized research centers allows access to cellular and cerebral organoid models to study synaptic plasticity, inflammation, and protein aggregation.

Développement et Vieillissement du Système Nerveux : Notre expérience depuis le début des années 2000 nous a permis d'explorer la chronologie de l'expression des sucres complexes tout au long de la vie d'un individu. L'équipe cartographie l'expression, en étendue et dans le temps, des héparanes sulfates et des sulfotransférases lors du développement du système nerveux normal et pathologique. L'utilisation de modèles innovants comme les embryons aviaires et les organoïdes cérébraux dérivés de cellules souches humaines permet de modéliser avec précision le développement neural et les phases précoces de sénescence.

Development and Aging of the Nervous System: Our experience since the early 2000s has allowed us to explore the chronology of complex sugar expression throughout an individual's life. The team maps the expression, in extent and over time, of heparan sulfates and sulfotransferases during normal and pathological nervous system development. The use of innovative models such as avian embryos and human stem cell-derived cerebral organoids allows for precise modeling of neural development and early phases of senescence.

Sénescence Cellulaire et Inflammation : Les travaux s'étendent aux phénotypes sénescents (vieillissement cellulaire accéléré). GlycUP étudie le rôle des protéoglycanes à héparane sulfate (HSPG) sur les cellules inflammatoires au sein du système nerveux, ainsi que leurs liens avec des phénomènes de mort cellulaire programmée et de dégradation tissulaire globale.

Cellular Senescence and Inflammation: The research extends to senescent phenotypes (accelerated cellular aging). GlycUP studies the role of heparan sulfate proteoglycans (HSPG) on inflammatory cells within the nervous system, as well as their links to programmed cell death and overall tissue degradation.

4. Outils et Plateformes Technologiques de Pointe

4. Cutting-Edge Tools and Technological Platforms

Pour mener ces recherches, GlycUp s'appuie sur des partenariats mettant à disposition des infrastructures technologiques hautement spécialisées. Microscopie et Imagerie : La Plateforme de Microscopie et d'Imagerie Avancée est incontournable. Équipée de microscopes confocaux, elle permet l'observation des interactions protéines toxiques/sucres. Notre partenaire y a développé Angiogenesis Analyzer, pour étudier la morphologie vasculaire et la barrière hémato-encéphalique. Expertise translationnelle : Notre approche se veut intégrée, combinant chimie analytique fine des glycannes, biologie cellulaire, et pharmacologie, pour un transfert fluide des découvertes fondamentales vers le milieu médical puis industriel.

To conduct this research, GlycUp relies on partnerships providing highly specialized technological infrastructures. Microscopy and Imaging: The Advanced Microscopy and Imaging Platform is essential. Equipped with confocal microscopes, it enables observation of toxic protein/sugar interactions. Our partner developed Angiogenesis Analyzer here, to study vascular morphology and the blood-brain barrier. Translational expertise: Our approach is integrated, combining fine glycan analytical chemistry, cell biology, and pharmacology for a smooth transfer of fundamental discoveries to the medical and then industrial sectors.

5. Innovations et Stratégies Thérapeutiques

5. Innovations and Therapeutic Strategies

Ne s'arrêtant pas à la compréhension fondamentale, GlycUP est partenaire dans le développement de la thérapie matricielle. Mimétiques de GAGs : L'équipe conçoit et teste des molécules de synthèse conçues pour imiter les fonctions des héparanes sulfates sains (des GAG-mimétiques). Ingénierie & Neuroprotection : En couplant ces mimétiques avec divers biomatériaux, le but est de recréer un microenvironnement protecteur autour des neurones lésés, d'entrer en compétition avec les protéines toxiques (Tau, Amyloïde) et de freiner la maladie d'Alzheimer.

Not stopping at fundamental understanding, GlycUP is a partner in the development of matrix therapy. GAG Mimetics: The team designs and tests synthetic molecules designed to mimic the functions of healthy heparan sulfates (GAG-mimetics). Engineering & Neuroprotection: By coupling these mimetics with various biomaterials, the goal is to recreate a protective microenvironment around damaged neurons, compete with toxic proteins (Tau, Amyloid), and slow down Alzheimer's disease.

« GlycUP se positionne aujourd'hui comme une agence partenaire des centres d'excellence majeurs dans la lutte contre le vieillissement cérébral.
En déplaçant la focale classique "intraneuronale" vers l'étude du microenvironnement glycanique du cerveau, l'équipe du Pr. Papy-Garcia ouvre des voies thérapeutiques et diagnostiques totalement inédites pour des maladies dévastatrices telles qu'Alzheimer ou Parkinson, tout en concédant des efforts significatifs dans l'accompagnement technique et le déploiement de méthodes d'approche. »

"GlycUP is positioned today as a partner agency of major centers of excellence in the fight against brain aging. By shifting the classic 'intraneuronal' focus to the study of the brain's glycanic microenvironment, Prof. Papy-Garcia's team opens up completely new therapeutic and diagnostic avenues for devastating diseases such as Alzheimer's or Parkinson's, while dedicating significant efforts to technical support and method deployment."

— Direction des opérations de GlycUp —

— GlycUp operation management —